В среднем инкубационный период составляет от 5 до 7 дней, реже может уменьшаться до четырех или увеличиваться до четырнадцати дней. Клиническая картина при аденовирусной инфекции очень разнообразна.
Заболевание может протекать в виде острой респираторной инфекции (ринофарингит, ринофаринготонзиллит, ларинготрахеобронхит), фарингоконъюнктивальной лихорадки, конъюнктивита и кератоконъюнктивита, аденовирусной пневмонии, энтерита и мезаденита. При этом следует отметить, что разнообразные клинические формы могут одновременно наблюдаться в одном эпидемическом очаге.